Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
NgfrQ9Z0W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NgfrQ9Z0W1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms