Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slfn1Q9Z0I7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn1Q9Z0I7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms