Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip2Q9Z0H8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms