Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slit3Q9WVB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slit3Q9WVB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Slit3Q9WVB4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms