Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV71

Asb4, Ankyrin repeat and SOCS box protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asb4Q9WV71 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asb4Q9WV71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Asb4Q9WV71 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297.3 ms