Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms