Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArcQ9WV31 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArcQ9WV31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArcQ9WV31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms