Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lemd3Q9WU40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lemd3Q9WU40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lemd3Q9WU40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms