Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scnn1bQ9WU38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms