Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn5Q9WU28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn5Q9WU28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn5Q9WU28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms