Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb3Q9R1P1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms