Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Wdr54Q9R0D8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Wdr54Q9R0D8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Wdr54Q9R0D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms