Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Lamc3Q9R0B6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lamc3Q9R0B6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms