Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf25Q9QZR0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf25Q9QZR0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms