Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas3Q9QZQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas3Q9QZQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms