Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf1Q9QZ09 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms