Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Tspan3Q9QY33 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan3Q9QY33 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan3Q9QY33 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms