Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxe3Q9QY14 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxe3Q9QY14 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxe3Q9QY14 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms