Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2e3Q9QXZ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms