Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nufip1Q9QXX8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nufip1Q9QXX8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms