Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip3Q9QXT8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms