Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apbb1Q9QXJ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apbb1Q9QXJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms