Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trp53inp1Q9QXE4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trp53inp1Q9QXE4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms