Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim44Q9QXA7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim44Q9QXA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms