Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdcQ9QW08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms