Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rai2Q9QVY8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms