Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cln8Q9QUK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms