Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csnk1eQ9JMK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms