Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx5Q9JKQ4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx5Q9JKQ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms