Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtrQ9JKK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms