Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmod2Q9JKK7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmod2Q9JKK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod2Q9JKK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms