Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem1Q9JKE2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms