Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pard6bQ9JK83 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6bQ9JK83 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms