Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga3Q9JJZ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga3Q9JJZ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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