Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng4Q9JJV4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacng4Q9JJV4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms