Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl3Q9JJR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms