Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfhx4Q9JJN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfhx4Q9JJN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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