Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc86Q9JJ89 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms