Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad9Q9JIW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms