Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r3fQ9JIG4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r3fQ9JIG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms