Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt1Q9JIF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prmt1Q9JIF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt1Q9JIF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms