Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird1Q9JI57 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird1Q9JI57 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms