Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Exosc9Q9JHI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Exosc9Q9JHI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms