Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkc1Q9ESX5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dkc1Q9ESX5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms