Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtn3Q9ES97 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtn3Q9ES97 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtn3Q9ES97 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms