Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ush1cQ9ES64 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ush1cQ9ES64 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms