Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3bQ9ES34 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3bQ9ES34 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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