Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trhr2Q9ERT2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trhr2Q9ERT2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms