Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk4Q9ERK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk4Q9ERK0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms