Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MesdQ9ERE7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MesdQ9ERE7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms