Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn2Q9ER65 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn2Q9ER65 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms